脉宽调制(PWM)信号中偶尔可能会出现异常信号，混合信号示波器可直接以亮点或其它醒目的形式将异常信号与深存储器中其它信号直接区分开来，即使是单次采集，也没有问题，而且还可以对这些异常的亮点进行放大观察、测量和分析。从图4种可以看到，对其中的一个亮点进行放大后，发现该异常是正脉冲末尾处有一短暂的幅值跌落，工程师然后可以具体测量该异常信号的时间和幅值信息。 

对于BGA等特殊封装形式以及使用FPGA的电路，本身电路可测的管脚不是很多，18个或20个通道往往已是不错，而且FPGA的供应商提供的开发工具，往往引出的管脚也有限，若使用Xilinx公司的芯片，安捷伦FPGA调试仪E5904B配合混合信号示波器使用，可以同时观察FPGA内部节点和外围信号的互动情况。 

目前大量使用的数字 示波器大都是2通道或4通道，当有大量数字信号需要被调试时，条件好的工程师会借助于逻辑分析仪，但孤立地使用逻辑分析仪或数字示波器对混合信号电路的调试效率往往是很低的。如很多时候，电路中的关键握手活动或特定任务执行的验证往往牵涉到模拟信号和多路数字信号必须在某个时间段按一定时序出现，因此需要把示波器和逻辑分析仪器同步起来一起使用